Analysen mit der TIQS Software

Die TIQS (The interactive QTL system) Software ist eine aktiv genutzte Infrastruktur zur kombinierten Auswertung von klinischen und molekularbiologischen Daten genotypisierter Individuen. Das System wurde so konzipiert, dass mehrere Projekte mit demselben Quellcode gleichzeitig bearbeitet werden können. Ihre Projekte könnten von diesem System zum Beispiel direkt profitieren durch:

• die Integration Ihrer existierenden Rechner-Infrastruktur für die intensiven Kalkulationen und/oder die Nutzung externer Dienstleistungen, etwa in Cloud environments
• die Bereitstellung einer kompletten, portablen Umgebung, die über den Webbrowser problemlos genutzt werden kann.

Sie erhalten tabellarische Übersichten der Effekte von genetischen Loci (auch Paaren von Loci) auf klinische oder molekulare Phenotypen. Es werden graphische Darstellungen (Scatter Plots, Venn Diagramme) zur Beschreibung von Cis-/Trans-eQTL unter Berücksichtigung klinischer Kovariaten angeboten. Das System gestattet auch die direkte Ausführung von R/qtl über das Web Interface.
Gemäß Ihren Wünschen ist die Immungenetics AG in der Lage, für Sie die Durchführung gesamter Expressions-QTL Projekte bzw. die Expressions-QTL Auswertung zu übernehmen oder aber durch entsprechende Schulungen Ihr Team für diese Analysen zu trainieren.
TIQS wird als Open Source Projekt geführt. Dies garantiert Ihnen einen dauerhaften Lizenz-freien Zugriff mit diesem System auf Ihre Daten. Weiterhin haben Sie, gerne auch mit unserer Unterstützung, die Möglichkeit

• der Nutzung und Teilhabe an stetigen Weiterentwicklungen durch andere Nutzer des Systems.
• des Austauschs von Informationen zu murinen Expressions-QTLs mit unserem Partner an der Universität Lübeck und (nach Absprache) auch weiteren Anwendern..

Für mehr Informationen über das System bitte hier klicken.